Программа Abbott по наблюдению и выявлению новых мутаций ВИЧ и гепатита В
К июню 2016 года более 34 млн людей во всем мире живут с ВИЧ-инфекцией, и каждый год фиксируется более 2,7 млн новых случаев. Проблема ВИЧ – огромная, она остро стоит во многих странах, в том числе и в России.
ВИЧ обладает огромной вариабельностью генома — способностью очень быстро мутировать — намного быстрее, чем, например, вирус гриппа. Именно поэтому с ВИЧ так сложно бороться: разработка вакцин и эффективной терапии упирается в то, что вирус опережает ученых.
Для решения этих задач необходимо, прежде всего, знать, с кем мы имеем дело — то есть знать обо всем разнообразии вируса, и о том, как он меняется.
Это важно понимать и для целей практической медицины: если, например, появилась новая группа, подтип или вариант ВИЧ, необходимы диагностические системы, которые могут их определять.
О том, как происходит изучение мутаций ВИЧ, его эволюции и о новых диагностических системах, которые позволяют улавливать малейшие изменения в геноме вируса, рассказал вице-президент отдела прикладных исследований и технологий компании Abbott доктор Джон Хэкет (John Hacket). Кстати, Abbott была первой компаний, создавшей в 1985 году тест на определение антител к ВИЧ, то есть тест, позволявший диагностировать вирус в крови.Дмитрий Бородачев, DатаРу Облако: Наше преимущество — мультивендорная модель предоставления облачных услуг 
Быстрее гриппа
К июню 2016 года известно о существовании двух типов - ВИЧ 1 и ВИЧ 2. ВИЧ 1 является наиболее распространенным типом и делится на группы – М (эта группа самая распространенная) ,N,O и P. Группа Р была обнаружена в 2009 году у женщины из Камеруна, которая приехала во Францию. В группе М существует еще и множество подтипов. При этом постоянно происходит образование новых вариантов. Не исключено, что скоро возникнут новые группы и подтипы вируса.
 | ВИЧ мутирует чрезвычайно быстро. Намного быстрее, чем вирус гриппа. Например, за 5-6 лет у одного человека с ВИЧ разнообразие вируса становится сопоставимым с разнообразием вируса гриппа среди всего человечества в мире, — говорит Джон Хэкет. |  |
Такая скорость мутации происходит по нескольким причинам. Во-первых, когда ВИЧ копирует себя, появляются «ошибки» или мутации в его генетической последовательности, что увеличивает его разнообразие.
Во-вторых, ВИЧ реплицируется (размножается) необыкновенно быстро: в больном, который не получает лечение, образуется до десяти миллиардов вирусных частиц в день.
В-третьих, вирус обладает способностью к рекомбинации: например, если человек инфицирован разными суб-типами ВИЧ, они рекомбинируют между собой в организме человека, что и приводит к образованию нового варианта вируса.
«Важно не пропустить новые формы»
Когда медикам и ученым стало понятно, что разнообразие ВИЧ столь велико, появилась необходимость в создании диагностических систем, которые могли бы не только определять все известные типы, группы и подтипы, но и выявлять новые. Ведь иначе можно получить ложноотрицательный результат, пропустив в образце варианты вируса, которых диагностическая система просто не знает.
| | Перед тем как донорская кровь используется, она проверяется на наличие инфекционных заболеваний. С помощью оборудования Abbott проводится скрининг 60% донорской крови в мире, — говорит Джон Хэкет. | |
Он добавляет, что компания очень серьезно подходит к выполнению своего обязательства — обеспечить безопасное переливание крови, поэтому в 1996 году была создана «Международная программа Abbott по наблюдению и выявлению новых мутаций ВИЧ и гепатита В».
| | Крайне важно, чтобы наши тесты могли достоверно определить все существующие мутации ВИЧ и гепатита, — подчеркивает Хэкет. | |
К июню 2016 года в рамках программы уже собрано более 25 тыс. образцов ВИЧ и гепатита В из 16 стран. Особое внимание уделяется очагам в Африке, поскольку именно там наблюдается максимальное разнообразие вариантов ВИЧ. В программе участвовали также 10 медицинских центров из России.
Для обнаружения новых вариантов ВИЧ используются самые современные научные методы, такие как секвенирование генома, включая глубокое секвенирование.
Для таких работ совместно с Калифорнийским университетом в Сан-Франциско (UCSF) был создан «Центр диагностики и исследований в области вирусологии UCSF-Abbott». Помимо изучения ВИЧ, там занимаются и поиском новых вирусов.
| | Недавно ученые из этого центра обнаружили совершенно новый человеческий вирус. Он получил название Human pegivirus 2 (HPgV-2). Известно, что он передается через кровь и связан с вирусом гепатита С. Нам удалось определить восемь полных геномов и четыре неполных генома этого вируса. Нашим следующим шагом станет определение того, способен ли новый вирус вызывать заболевание, и если да, продолжать работу с учреждениями службы крови, чтобы обеспечить защиту донорской крови от этих типов новых вирусов, — говорит Хэкет.[1] | |
Примечания
